分水岭算法的python实现及解析
1 算法简介分水岭算法的原理很容易查到,就是往山谷中注水,把不同湖水接触的位置称作分水岭,这么做的结果有两个:1.得到整个区域的分界线2.把整个区域编号这是一种很容易过分割的算法,需要一些预处理手段和一些优化,本文只解析基本原理(下图的注水过程是一种基于人为标记的方法)2 代码步骤说明分水岭算法的步骤如下:1.将图像的所有像素按像素值从小到大排序,这里可以利用直方图将像素信息塞入数组2.开始按灰度
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1 算法简介
分水岭算法的原理很容易查到,但是很多文章都是直接用的opencv或matlab函数,看不到具体实现方法,这篇文章希望能对大家有点帮助。
分水岭算法就是往山谷中注水,把不同湖水接触的位置称作分水岭,这么做的结果有两个:
1.得到整个区域的分界线
2.把整个区域编号
这是一种很容易过分割的算法,需要一些预处理手段和一些优化,本文只解析基本原理
(下图的注水过程是一种基于人为标记的方法)
2 代码步骤说明
分水岭算法的步骤如下:
1.将图像的所有像素按像素值从小到大排序,这里可以利用直方图将像素信息塞入数组
2.开始按灰度级从小到大顺序遍历所有像素,先将该灰度级的全部像素标记为待计算点,若点的邻域内有已存在的水池,则放入一个队列(先将水池边缘像素入队)
3.开始遍历队列,直到队列为空
3.1 若当前像素周围没有已经编号过的像素,则是新的水池
给与一个新的编号,并将邻域内的同灰度级像素加入队列
一直遍历队列到队列为空,即将这个新水池底部填满
3.2 若像素周围有已经计算过的像素则看情况:
3.2.1 如果周围有2个不同的水池编号,则是分水岭
3.2.2 如果周围只有1个水池编号,则该点也是这个编号
3.2.3 周围有同层(待计算点),入队
4.开始计算下一个灰度级
所以这个算法就是从每个水池的边界开始一圈一圈,一个灰度级一个灰度级地向外蔓延的过程
3 python实现
import cv2
import numpy as np
from queue import Queue#队列
maxhigh = 255 #水位
mask = -2 #用于标记每次涨水时,将会被水淹没的像素
watershed = 0 #用于标记分水岭边缘
#fixmark = np.array([-1,-1])#用于隔开队列的每个部分
def checkedge(inputidx,w,h):
if inputidx[0] >= h:
return -1
if inputidx[1] >= w:
return -1
if inputidx[0] < 0:
return -1
if inputidx[1] < 0:
return -1
return 0
#def mark_end_que(que):
# que.put(fixmark)
def water(inputimg, size):
imsize = size[0]*size[1]
w = size[1]
h = size[0]
pixarray = np.zeros([imsize,2])#用于储存所有像素,以及坐标
labelout = np.zeros(size)-1
#distance = np.zeros(size)
putquemask = np.zeros(size)
labelsize = np.zeros(imsize)
cnt = np.zeros(257)#累积直方图
currenLabel = 0#湖区标号
que = Queue(maxsize=0)#创建队列
neighborbias4 = np.array([[0,-1],[-1,0],[0,1],[1,0]])#邻域偏移
#neighborbias8 = np.array([[0,-1],[-1,-1],[-1,0],[-1,1],[0,1],[1,1],[1,0],[1,-1]])#邻域偏移
#计算直方图,知道每个灰度级的位置
hist = cv2.calcHist([inputimg],[0],None,[256],[0,256])
#累计直方图的点就是每个灰度级在pixarray中的起始位置,但是要去除空的点
hist[0] = hist[0] - 1#由于累积直方图是作为下标使用,因此最终求和结果不可等于imsize
histsum = 0
for i in range(0,256):
histsum = histsum + hist[i]
cnt[i+1] = histsum
cnt = cnt.astype(np.int32)
cntidx = cnt[1:257].copy()
#遍历图片记录全部像素,根据累积直方图排列像素顺序,到时候按顺序从低到高一个个涨水
for y in range(0,h):
for x in range(0,w):
pix = inputimg[y,x]
pixarray[(cntidx[pix]),:] = y,x
cntidx[pix] = cntidx[pix] - 1
#准备完成,开始涨水
for nowgraylevel in range(0,maxhigh+1):
print(nowgraylevel)
#标记当前层灰度
for idx in range(cnt[nowgraylevel],cnt[nowgraylevel+1]+1):
nowpixaxis = pixarray[idx].astype(np.int32)
labelout[nowpixaxis[0],nowpixaxis[1]] = mask
#把在水池边缘的当前灰度级入队
for nei in range(0,4):
neighboraxis = nowpixaxis + neighborbias4[nei]
if checkedge(neighboraxis,w,h) < 0:
continue
if labelout[neighboraxis[0],neighboraxis[1]] >= 0:#周围有已经计算过的
putquemask[neighboraxis[0],neighboraxis[1]] > 0#标记已经入队过了
que.put(nowpixaxis)#入队
break
#开始遍历队列
while(True):
if que.empty():
break
nowpixaxis = que.get()
#蔓延过程
#1 周围有1个label,加入其中
#2 周围两个不同label,分水岭
#3 周围无label,新水池
#4 周围有同层,入队蔓延
for nei in range(0,4):
neighboraxis = nowpixaxis + neighborbias4[nei]
if checkedge(neighboraxis,w,h) < 0:
continue
labelnow = labelout[nowpixaxis[0],nowpixaxis[1]]
labelneighbor = int(labelout[neighboraxis[0],neighboraxis[1]])
if labelnow == -2 and labelneighbor > 0:
labelout[nowpixaxis[0],nowpixaxis[1]] = labelneighbor
labelsize[labelneighbor] = labelsize[labelneighbor] + 1
elif labelnow > 0 and labelneighbor > 0 and labelnow != labelneighbor:
labelout[nowpixaxis[0],nowpixaxis[1]] = 0
if labelneighbor == -2 and putquemask[neighboraxis[0],neighboraxis[1]] == 0:
que.put(neighboraxis)
putquemask[neighboraxis[0],neighboraxis[1]] = 1#标记这个像素已经入队了不要重复使用
#找到了新的水坑(邻域没有水)
for idx in range(cnt[nowgraylevel],cnt[nowgraylevel+1]+1):
nowpixaxis = pixarray[idx,:].astype(np.int32)
if(labelout[nowpixaxis[0],nowpixaxis[1]] == -2):#经过之前的赋值,仍然没有被标记的是新水池
#print("new pool %d",)
currenLabel = currenLabel + 1
#配置序号
labelout[nowpixaxis[0],nowpixaxis[1]] = currenLabel
que.put(nowpixaxis)
#将新坑底所有同灰度级像素都填上水
while not que.empty():
nowpixaxis = que.get()
for nei in range(0,4):
neighboraxis = nowpixaxis + neighborbias4[nei]
#防越界
if checkedge(neighboraxis,w,h) < 0:
continue
if putquemask[neighboraxis[0],neighboraxis[1]] == 0 and labelout[neighboraxis[0],neighboraxis[1]] == -2:
labelout[neighboraxis[0],neighboraxis[1]] = currenLabel
que.put(neighboraxis)
putquemask[neighboraxis[0],neighboraxis[1]] = 1
labelsize[currenLabel] = labelsize[currenLabel] + 1
return labelout
image = cv2.imread('F:/tf_learn--------/impo/coin3.png') #F:/tf_learn--------/impixiv/1606.jpg #F:/tf_learn--------/impo
gray = cv2.cvtColor(image,cv2.COLOR_BGR2GRAY, cv2.CV_16S)
size = gray.shape # h w c
#二值化
ret,gray = cv2.threshold(gray,40,255,cv2.THRESH_BINARY)
cv2.imshow("ret",gray)
cv2.waitKey(0)
#膨胀
kernel = np.ones((5,5),np.uint8)
gray = cv2.dilate(gray,kernel)
#腐蚀
gray = cv2.erode(gray,kernel)
#边缘检测
#edgeimage = np.uint8(np.abs(cv2.Sobel(gray,cv2.CV_16S, 1, 1, ksize=3)))#这个sobel不太方便
edgeimage = cv2.Canny(gray, 10, 100)
cv2.imshow("gray",edgeimage)
cv2.waitKey(0)
label = water(edgeimage,size)
label = cv2.resize(label,(size[1],size[0]))
#标记
b=image[:,:,0]
g=image[:,:,1]
r=image[:,:,2]
r[label==0] = 255
g[label==2] = 255
b[label==3] = 255
b[label==4] = 125
g[label==4] = 125
largeimage = cv2.resize(image,(size[1],size[0]),cv2.INTER_LINEAR)
cv2.imshow("lab",largeimage)
cv2.waitKey(0)
4 效果
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